Morales ha actuat com a solista arreu del món, principalment en prestigiosos festivals internacionals de música antiga a països com els Estats Units, Costa Rica, Suïssa, França o Regne Unit. També com a solista ha gravat diferents CDs com ara Música Sorprendente i Soler and Scarlatti in London.

Especialista en el patrimoni espanyol d'instruments i música de tecla, Luisa Morales té una llarga trajectòria com a investigadora i docent, publicant articles en diverses revistes internacionals de musicologia. És reviewer per a Oxford University Press de la sèrie Currents in Latin American&Iberian Music i col·laboradora de la nova edició del Grove’s Dictionary of Musical Instruments.